基因敲除 vs 基因敲入:如何選擇?
“導(dǎo)師說(shuō)這個(gè)基因很重要,需要研究它的功能。但我查了很多文獻(xiàn),有的用敲除,有的用敲入,我該怎么選?”這恐怕是很多科研新手都會(huì)遇到的困惑。在基因編輯的實(shí)驗(yàn)室里,“敲除”和“敲入”是出現(xiàn)頻率最高的兩個(gè)詞。不少剛接觸科研的小伙伴會(huì)困惑:同樣是編輯基因,兩者到底有啥區(qū)別?什么時(shí)候該用敲除,什么時(shí)候該選敲入?

今天,我們就來(lái)徹底理清這兩個(gè)關(guān)鍵技術(shù),幫你做出明智選擇。
核心概念
基因敲除(Knockout, KO)
“斷其后路”,讓基因“失效”
你可以理解為 ?“精準(zhǔn)刪除”?。它的目標(biāo)是通過(guò)編輯技術(shù),讓細(xì)胞內(nèi)某個(gè)特定的基因完全失去功能。想象一下,你把一本書里的某一章徹底撕掉,這本書就再也無(wú)法提供那一章的信息了。常用的方法包括插入失活突變或直接敲除特定基因序列。

基因敲入(Knockin, KI)
“錦上添花”,給基因“加功能”
是 ?“精準(zhǔn)插入”?。它的目標(biāo)是將一段外源的基因序列(可以是一個(gè)報(bào)告基因、一個(gè)突變版本或一個(gè)全新基因)引入到基因組中的特定位點(diǎn)。這就好比你在書中的特定位置,工整地粘貼上了一頁(yè)新的內(nèi)容。

核心差異對(duì)比

如何選擇?從你的科學(xué)問(wèn)題出發(fā)
不用死記硬背,記住3個(gè)核心場(chǎng)景,就能快速?zèng)Q策——結(jié)合具體實(shí)驗(yàn)?zāi)康?,?duì)號(hào)入座即可:
場(chǎng)景1:
想知道“這個(gè)基因有什么用”—選基因敲除
如果你不清楚某個(gè)基因的功能,最直接的方法就是“關(guān)掉”它,觀察后續(xù)變化:
- 比如研究某基因與腫瘤的關(guān)系:敲除腫瘤細(xì)胞中的該基因,若細(xì)胞增殖變慢、凋亡增加,說(shuō)明該基因可能是促癌基因;
- 比如探索代謝通路:敲除通路中的某個(gè)基因,若通路下游產(chǎn)物減少,說(shuō)明該基因是通路的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn);
- 經(jīng)典案例:通過(guò)敲除小鼠的特定基因,構(gòu)建遺傳病模型,研究疾病的發(fā)病機(jī)制——這也是基因敲除技術(shù)最早、最成熟的應(yīng)用之一,早在2009年就有相關(guān)技術(shù)體系用于小鼠模型構(gòu)建。
場(chǎng)景2:
想“追蹤/修飾”基因/蛋白——選基因敲入
如果你的實(shí)驗(yàn)需要精準(zhǔn)定位、定量,或是模擬特定突變,敲入就是最佳選擇:
- 蛋白定位:將GFP基因敲入目標(biāo)蛋白基因的末端,融合表達(dá)后,通過(guò)熒光顯微鏡就能實(shí)時(shí)看到蛋白在細(xì)胞內(nèi)的分布(比如是在細(xì)胞核還是細(xì)胞質(zhì));
- 突變模擬:將人類遺傳病的致病突變序列敲入小鼠基因組,構(gòu)建精準(zhǔn)的疾病模型,用于藥物研發(fā)和治療方案測(cè)試;
- 基因治療:在臨床研究中,通過(guò)敲入正?;?,替代患者體內(nèi)的致病基因,比如治療囊性纖維化、遺傳性耳聾等單基因遺傳病——目前這類技術(shù)已進(jìn)入臨床試驗(yàn)階段,展現(xiàn)出廣闊的應(yīng)用前景。
場(chǎng)景3:
特殊需求:兩者結(jié)合使用
很多復(fù)雜實(shí)驗(yàn)會(huì)同時(shí)用到敲除和敲入:比如先敲除內(nèi)源的致病基因,再敲入正常的野生型基因,驗(yàn)證基因功能的同時(shí),探索治療可能性;或是在敲入報(bào)告基因的同時(shí),敲除另一等位基因,實(shí)現(xiàn)“一邊追蹤、一邊沉默”的雙重目的。
基因敲除和敲入,
本質(zhì)是“減法”與“加法”的區(qū)別:
- 做“減法”(失活基因)→ 選敲除,適合基因功能研究、致病基因篩選,操作簡(jiǎn)單、效率高;
- 做“加法”(插入/修飾基因)→ 選敲入,適合蛋白追蹤、突變模擬、基因治療,精準(zhǔn)度高、應(yīng)用更精細(xì)。

沒(méi)有最好的技術(shù),只有最合適的選擇。 下一次當(dāng)你陷入選擇困境時(shí),不妨停下來(lái),再次明確你的核心科學(xué)問(wèn)題:你究竟想揭示生命的哪一種“缺失”或“存在”?
答案,就在問(wèn)題本身之中。如果還是不確定自己的實(shí)驗(yàn)該選哪種,不妨留言說(shuō)說(shuō)你的實(shí)驗(yàn)?zāi)康模?xì)胞/動(dòng)物模型、研究方向),幫你快速鎖定最優(yōu)方案~
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常州卡文斯實(shí)驗(yàn)動(dòng)物有限公司成立于2011年,是一家專業(yè)從事實(shí)驗(yàn)動(dòng)物生產(chǎn)、銷售及相關(guān)技術(shù)服務(wù)的生物科技公司。公司目前擁有一批具備多年生物醫(yī)藥行業(yè)經(jīng)驗(yàn)的核心技術(shù)專家,并組建了疾病動(dòng)物模型研發(fā)、胚胎工程等技術(shù)平臺(tái),培養(yǎng)了大批專業(yè)從事實(shí)驗(yàn)動(dòng)物生產(chǎn)管理和技術(shù)服務(wù)的人員。
經(jīng)過(guò)15年在動(dòng)物疾病模型領(lǐng)域的精耕細(xì)作及技術(shù)積淀,公司已建立代謝類、免疫腫瘤、心血管及神經(jīng)系統(tǒng)等多種人類疾病動(dòng)物模型,并于2018年推出胚胎/精子復(fù)蘇冷凍、快速擴(kuò)繁、受托繁育、生物凈化、DIO飲食誘導(dǎo)肥胖、動(dòng)脈粥樣硬化造模等一系列技術(shù)服務(wù),受到市場(chǎng)廣泛認(rèn)可。目前已在常州和蘇州兩地按照國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)建設(shè)了6000m2實(shí)驗(yàn)動(dòng)物生產(chǎn)基地,基地年生產(chǎn)疾病模型動(dòng)物達(dá)100多萬(wàn)只。

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